Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC31BQ9NQW1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC31BQ9NQW1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms