Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPJQ9HC77 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms