Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SCAF1Q9H7N4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms