Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB1BQ9H0U4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms