Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms