Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
GPR88Q9GZN0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPR88Q9GZN0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPR88Q9GZN0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPR88Q9GZN0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GPR88Q9GZN0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPR88Q9GZN0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPR88Q9GZN0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPR88Q9GZN0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPR88Q9GZN0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPR88Q9GZN0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPR88Q9GZN0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPR88Q9GZN0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPR88Q9GZN0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms