Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM4Q9C037 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM4Q9C037 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms