Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG6Q9BXT2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms