Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms