Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms