Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PRADC1Q9BSG0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PRADC1Q9BSG0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms