Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC39A3Q9BRY0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms