Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDF4Q9BRK5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms