Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms