Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms