Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX7

C7orf25, UPF0415 protein C7orf25, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf25Q9BPX7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C7orf25Q9BPX7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C7orf25Q9BPX7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms