Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP19Q99542 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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