Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms