Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2Q96Q42 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms