Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NLRP3Q96P20 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms