Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms