Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD4Q96M96 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms