Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms