Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms