Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms