Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms