Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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