Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CELF1Q92879 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CELF1Q92879 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms