Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRUQ92729 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms