Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D1Q8WV19 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms