Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms