Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAAF3Q8N9W5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms