Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVBPQ8N300 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVBPQ8N300 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms