Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC2Q8N158 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC2Q8N158 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms