Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED13LQ71F56 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms