Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM179Q6ZVK1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms