Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP47Q6ZTR5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms