Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms