Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms