Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00114Q6XXX2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms