Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms