Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL17Q6UXB2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms