Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
METAP1DQ6UB28 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
METAP1DQ6UB28 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms