Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms