Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZN7

HCP5, HLA class I histocompatibility antigen protein P5, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCP5Q6MZN7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCP5Q6MZN7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HCP5Q6MZN7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms