Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECM29Q5VYK3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms