Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM78BQ5VT40 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms