Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q5VSD8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms