Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NHSL1Q5SYE7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHSL1Q5SYE7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms