Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms